
1.PROTAC分子通過其一端的靶蛋白配體(POI Ligand)特異性識別并結合靶蛋白,通過其另一端的E3泛素連接酶配體(E3 Ligase Ligand)特異性識別并結合E3 Ligase;
2.形成P O I - P R O T A C - E3 ligase三元復合體;
3. 在此三元復合體中,靶蛋白POI被E3 ligase泛素化修飾,泛素化修飾了的POI隨后被蛋白酶體識別并降解,由此抑制靶蛋白的功能。

- 改變靶點的“不可成藥性”(undruggable)PROTAC的作用分子機制是通過泛素-蛋白酶體系統降解靶蛋白,并非通過競爭結合以封閉靶蛋白功能區而發揮蛋白功能抑制作用,因此PROTAC對靶蛋白識別結合區不一定非得是活性區,結合力也不一定必須是高親和力;這使得一些缺乏高親和力小分子結合的“不可成藥性”靶蛋白變成“可成藥性”。
- 高效性傳統小分子抑制劑通過競爭結合靶蛋白活性功能域而抑制靶蛋白功能,所需小分子的量往往較大;而PROTAC通過泛素-蛋白酶體系統降解靶蛋白以解除靶蛋白功能,故具有可循環使用性、用量低和高效性的特點。
- 無免疫原性與抗體藥物相比,PROTAC不會引發抗藥抗體產生。綜上,PROTAC已成為藥物研發領域的新興利器,在國內外備受科研單位及藥企所追捧。

- 靶標蛋白PROTAC-POI的設計合成美迪西匯總了當前流行的熱門POI配體,不同組織類型的E3ligase配體,并且建立了含數百種連接分子的linker庫。此外,美迪西成熟的計算機輔助藥物設計技術平臺,大大提高PROTAC-POI的設計合成質量。
- PROTAC-POI的體外篩選HEK 293T穩轉株細胞(POI-EGFP)高通量篩選利用基因敲入技術構建的“內源蛋白-EGFP”293T穩轉株細胞,對PROTAC分子進行高通量篩選,計算IC50。
Percentage reduction in POI-EGFP fusion protein level
Western Blot(WB)通過WB實驗檢測初篩到的PROTAC分子對靶標蛋白的降解能力,分析DC50值。Fig. 2 Western Blot Images showing POI degradation by PROTAC-POI
細胞毒性實驗(CCK-8或CTG法)檢測上述篩選到PROTC-POI對癌細胞增殖抑制能力,分析IC50值。機制檢測:a. 檢測PROTAC是否通過E3 CRBN對靶蛋白進行降解。CUL4-CRBN E3 Ligase mediates PROTAC-POI-induced POI Degradation
b. 特異性檢測:通過利用LC-MS/MS進行蛋白組學分析,確定PROTAC降解蛋白的特異性;利用KINOMEscan分析PROTAC對激酶結合的特異性。Proteasome system mediates PROTAC-POI-induced POI Degradation
腫瘤細胞的增殖抑制效應:利用CCK-8或CTG法,檢測PROTAC對腫瘤細胞的增殖抑制效果。Proliferation inhibition effects of POI in the indicated cell lines at 120 h after treatment
- PROTAC-POI的動物體內藥效篩選CDX小鼠腫瘤模型將相應癌種細胞系移植到裸鼠或NSG小鼠體內,建立皮下瘤或原位瘤模型,通過口服、灌胃或靜脈給藥,檢測體外篩到的PROTAC-POI對鼠體內腫瘤生長的抑制效果。
Cancer Type Orthotopic Model Orthotopic Model (Luc Cell Line) 膠質母細胞瘤 U87-MG U87-MG-luc 肺癌 NCI-H1650, A549, NCI-H1975, NCI-H460, LLC1 A549-luc, LLC1-luc,NCI-H1975-luc 結腸癌 HCT-116, LoVo HT29-luc 胃癌 Hs 746T 胰腺癌 Mia-Paca 2 Mia-Paca 2-luc 乳腺癌 MDA-MB-231 4T1-luc 卵巢癌 SK-OV-3 SK-OV-3-luc 前列腺癌 PC3 PC-3-luc 腎癌 A498 膀胱癌 UM-UC-3 黑色素瘤 B16-F10-luc 肝癌 H22 骨癌 - PROTAC-POI的動物體內藥效篩選PDX小鼠腫瘤模型將腫瘤組織以組織塊的形式移植到NSG小鼠體內,這些腫瘤組織在NSG小鼠體內保持了原始腫瘤的生物學特征,與臨床特征相似度更高。利用PDX小鼠模型檢測PROTAC-POI對體內腫瘤生長的抑制效果。
癌癥類型 細胞系 結腸癌 PDXM-008C, PDXM-016C, PDXM-020C, PDXM-021C, PDXM-057C, PDXM-060C, PDXM-075C, PDXM-076C, PDXM-087C, PDXM-104C, PDXM-095C, PDXM-084C, PDXM-072C, PDXM-069C, PDXM-057C, PDXM-015C, PDXM-002C, 肺癌 PDXM-054Lu, PDXM-050Lu, PDXM-047Lu, PDXM-053Lu, PDXM-028Lu, 胃癌 PDXM-092Ga, PDXM-091Ga, 乳腺癌 PDXM-201B, PDXM-202B, PDX-203B 肝癌 PDXM-211Li, PDXM-212Li 胰腺癌 PDXM-221Pa, PDXM-222Pa 膀胱癌 PDXM-231U, PDXM-232U 淋巴瘤 PDXM-241Ly, PDXM-242Ly - PROTAC-POI的動物體內藥效篩選PK/PD研究、藥學分析、藥物代謝動力學研究和安全性評價對動物體內藥效檢測篩選得到的理想的PROTAC-POI進行PK/PD研究、藥學分析、藥物代謝動力學研究和安全性評價,并匯總實驗結果和材料進行IND申報,以助力客戶加快PROTAC-POI藥物的研發進程。